本文来自微信公众号：奇点网（ID：geekheal_com），作者：奇点糕，原文标题：《〈柳叶刀〉子刊：喝酒易得肝癌？看你有没有这个突变！首个酒精相关肝癌患者的GWAS，发现了一对重要癌相关基因丨临床大发现》，题图来自：《雷神3》
大家有没有过类似的迷思：身边有的朋友，疯狂熬夜肝论文，炸鸡奶茶快乐水不停歇，一天只睡5个小时依旧生龙活虎，而自己，但凡晚睡一个小时，第二天就会大脑空白，心率过快，双眼无神，不停脱发……
虽然必须承认，生活习惯不好是真的，但是怎么就有人那么“扛造”？就比如喝酒对肝不好，这是一个常识，但事实上，有相当一部分长期酗酒的人没有发展成肝癌。
近期在《柳叶刀·肿瘤学》发表的一篇文章中，来自法国和比利时的科学家进行了一项全基因组关联研究（GWAS），探究了与饮酒相关肝细胞癌（HCC）有关的致病基因在群体遗传过程中扮演的角色。他们发现了一对可能与饮酒相关HCC的基因WNT3A-WNT9A，该基因在Wnt-β-连环蛋白通路中可能扮演了一个与肝癌发展相关的早期角色。这也是首次在该类患者中进行的GWAS[1]。
在全球HCC患者中，饮酒相关肝病导致的病例数占到了将近1/3 [2]。一些临床研究发现，与饮酒相关且可能导致HCC的危险因素包括高龄、男性、肝纤维化等，但一些长期饮酒并占据以上危险因素的人并没有进展成为HCC [2-4]，说明除了环境因素，个体的基因差异也起着决定性的作用。
过去的GWAS研究已经发现了两个常见的与HCC风险增加有关的单核酸碱基突变：PNPLA3中的rs738409(C>G)和TM6SF2中的rs58542926(C>T)[5,6]，以及一个与HCC风险降低有关的，HSD17B13中的rs72613567(T>TA)[7]。
本研究针对这些已发现的常见的单核酸碱基突变，进行了一次GWAS研究，以帮助我们更好地理解这些基因在与酒精相关的HCC及肝癌化致病过程中的影响。
研究对象是不具备亲属关系的患有酒精相关肝病的欧洲病人，共分为3个阶段：发现队列、验证队列以及荟萃分析。
在发现队列中，研究人员分析了775个HCC患者（病例组）与1332个非HCC肝病患者（非病例组）的样本，结果显示，SUGP1基因中的rs8107974与TM6SF2中的rs5852926处于高度的连锁不平衡状态，这意味着7974与2926这两对碱基对更可能会共同遗传。类似地，PNPLA3中的rs2294915与rs738409、WNT3A-WNT9A中的rs708113与同区域中另外两对单核酸碱基对也处于高度的连锁不平衡状态。
与HCC风险降低有关的HSD17B13这个基因也在发现队列中得到了验证，但未达到GWAS级别的显著性差异。值得注意的是，在发现队列中，研究人员确定了第三个与HCC风险增加有关的基因：WNT3A-WNT9A。他们在验证队列中也被确认了，这三个基因的确与HCC风险增加有关。
研究人员还在荟萃分析中研究了携带基因突变的个数和饮酒相关HCC发生风险的关系。根据分析结果，突变携带数量与酒精相关HCC的发生率存在累加效应，即携带的突变越多，酒精相关HCC的发生风险越大。即便调整了年龄、性别与肝纤维化阶段这些混杂因素后，结果仍然如此。
总的来说，以上三个阶段的分析首先确认了四个基因突变（三增一减）与酒精相关HCC风险有关，但其中与风险降低的突变的影响不够显著。另外，携带的突变越多，发生HCC的风险越高，且与年龄、性别等因素无关。
另外，为了与其它类型的慢性肝病（慢性丙肝、慢性乙肝、非酒精性脂肪肝）作比较，研究人员在以上三种慢性肝病患者中也做了GWAS研究。他们发现，WNT3A-WNT9A基因中的rs708113与这三种慢性肝病发展成HCC的风险无关，而其他三种突变与非酒精性脂肪肝发展为HCC的风险有显著的相关性。
研究人员提取了酒精相关HCC患者的非肿瘤组织，发现WNT3A-WNT9A rs708113[T]碱基对的突变与炎症因子和自然杀伤细胞的高表达相关。
同时，他们还研究了这个基因在酒精相关HCC患者与非酒精相关HCC患者中的表达水平差异。在此之前，我们先简单了解一种在酒精相关HCC患者中常见的基因突变——CTNNB1基因突变，它与Wnt-β-连环蛋白通路的激活和肿瘤环境低免疫浸润相关，而以上两种情况都与HCC的发生有关 [8,9]。
研究者发现，酒精相关的HCC患者中CTNNB1基因突变比非酒精相关HCC患者多，但在酒精相关的HCC患者中，发生WNT3A-WNT9A rs708113突变的患者，CTNNB1基因的突变却有所降低。这两种基因突变的“跷跷板式”平衡与饮酒的量有关，研究人员只在饮酒的HCC患者中发现了它们的相关性。
至此，本研究在基因水平上证明了已发现的常见基因突变与酒精相关HCC的相关性，且完成了对WNT3A-WNT9A rs708113的发现及验证。由于WNT3A和WNT9A编码Wnt-β-连环蛋白通路的配体 [10]，而该通路在肝病的发展、代谢和肝癌化进程中扮演了重要的角色，因此该通路的突变可能会严重影响到调控基因的信号转导。
酒精相关的HCC通常预后不佳，而这些发现肯定了WNT3A-WNT9A基因座在酒精相关HCC发病中的重要作用，在未来治疗酒精相关HCC的过程中可能成为潜在靶点。不过，关于rs708113突变是否对肿瘤组织中的WNT3A-WNT9A表达量有影响，或者是否会直接影响肿瘤微环境，仍需要继续探索。
参考文献：
1. Eric Trépo, et al. Common genetic variation in alcohol-related hepatocellular carcinoma: a case-control genome-wide association study, The Lancet Oncology, 2021,
2. Llovet JM, Kelley RK, Villanueva A, et al. Hepatocellular carcinoma. Nat Rev Dis Primers 2021; 7: 6.
3. Yu MW, Chang HC, Liaw YF, et al. Familial risk of hepatocellular carcinoma among chronic hepatitis B carriers and their relatives. J Natl Cancer Inst 2000; 92: 1159–64.
4. Hemminki K, Li X. Familial liver and gall bladder cancer: a nationwide epidemiological study from Sweden. Gut 2003; 52: 592–96.
5. Trépo E, Nahon P, Bontempi G, et al. Association between the PNPLA3 (rs738409 C>G) variant and hepatocellular carcinoma: evidence from a meta-analysis of individual participant data. Hepatology 2014; 59: 2170–77.
6 Yang J, Trépo E, Nahon P, et al. PNPLA3 and TM6SF2 variants as risk factors of hepatocellular carcinoma across various etiologies and severity of underlying liver diseases. Int J Cancer 2019; 144: 533–44.
7. Abul-Husn NS, Cheng X, Li AH, et al. A protein-truncating HSD17B13 variant and protection from chronic liver disease. N Engl J Med 2018; 378: 1096–106.
8. Schulze K, Imbeaud S, Letouzé E, et al. Exome sequencing of hepatocellular carcinomas identifies new mutational signatures and potential therapeutic targets. Nat Genet 2015; 47: 505–11.
9. Ruiz de Galarreta M, Bresnahan E, Molina-Sánchez P, et al. β-catenin activation promotes immune escape and resistance to anti-PD-1 therapy in hepatocellular carcinoma. Cancer Discov 2019; 9: 1124–41.
10. Parsons MJ, Tammela T, Dow LE. WNT as a driver and dependency in Cancer. Cancer Discov 2021; 11: 2413–29.
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