网传图片显示，南京九华山公园玄奘寺内共供奉4名参与南京大屠杀侵华日军战犯，其中包括南京大屠杀主犯田中军吉、南京大屠杀的主要负责人之一的甲级战犯松井石根、乙级战犯谷寿夫，以及在臭名昭著的南京杀人比赛参与者——丙级战犯野田毅。
7月22日清晨，南京市民族宗教事务局官方微博(@南京民宗)发布情况通报称，21日晚，玄武区民族宗教事务局接到玄奘寺供奉牌位有关情况的举报后，立即会同公安等部门连夜赶往现场调查。
据情况通报显示，今年2月份，寺方发现相关情况后，已予以纠正。针对上述情况，玄武区民族宗教事务局决定对该寺开展整顿。该部门将对伤害民族感情的行为一查到底，有关调查处理情况将及时公布。
玄奘寺内竟然供奉有日本战犯的牌位，7月22日下午，作为玄奘长兄第四十七代世孙的洛阳人陈小顺告诉顶端新闻记者，他已注意到网上关于南京玄奘寺的信息，“他们做得不对”，不仅伤害了民族感情，也玷污了“玄奘”的清誉，玄奘家族后人对此表示反对。
陈小顺介绍，玄奘本姓陈名祎，洛阳缑氏(今河南省洛阳市偃师区缑氏镇)人。13岁出家，21岁受具足戒。曾陈表朝廷奏请去西方求法，未被允准。
唐贞观三年(629年)，朝廷因饥荒允许百姓自行求生，他即从长安出发，经姑臧出敦煌，经今新疆及中亚等地，辗转到达中印度摩揭陀国王舍城。进入当时印度佛教中心那烂陀寺，着重钻研《瑜伽师地论》，兼学梵书《声明记论》。
玄奘于贞观十九年返回长安。史书记载，玄奘西行求法，往返十七年，旅程五万里，所历“百有三十八国”，带回大小乘佛教经律论共五百二十夹，六百五十七部。归国后受唐太宗召见，住长安弘福寺，后又住大慈恩寺。
从贞观十九年开始，约二十年间，玄奘主要从事译经事业，先后译出大小乘经论共七十五部一千三百三十五卷，其中主要有《大般若经》《大菩萨藏经》《瑜伽师地论》等。他还曾把《老子》和《大乘起信论》译为梵文，传入印度;将入印路途见闻撰写《大唐西域记》十二卷，是记录当时西域和丝绸之路的珍贵典籍。
为了纪念玄奘，洛阳市偃师区缑氏镇当地建有玄奘寺、玄奘故里等，“玄奘之路”活动当年即从缑氏镇玄奘故里出发。此次事件中涉及的南京玄奘寺，亦是为纪念玄奘所建。
曾任中国玄奘研究中心研究员、副秘书长，现为洛阳市玄奘文化研究会会长的董煜焜，7月22日下午接受采访时刚刚听说南京玄奘寺内供奉日本战犯一事，他表示很震惊很愤怒，“这是不可饶恕的罪行。”
7月22日下午，“南京发布”发布《关于玄奘寺供奉牌位事件有关人员的处理情况》。
玄奘寺供奉南京大屠杀战犯牌位事件造成恶劣影响，对此，南京市委市政府高度重视，迅速成立工作专班进行调查处置并决定：
责成玄武区民族宗教事务局撤换传真(俗名李义将)玄奘寺主要负责人职务;责令玄奘寺停止日常活动，并会同相关部门立即对其进行整顿。
责成玄武区委按程序免去区民族宗教事务局局长胡圆圆职务。
对市民族宗教事务局局长苏宇红予以诫勉。
对市民族宗教事务局副局长纪勤予以停职检查。
下一步，纪检监察机关、公安机关将对相关单位和人员作进一步调查，并依规依纪依法作出处理，绝不姑息。