2016年，李在镕卷入韩国前总统朴槿惠受贿案中，并于2017年2月17日被捕。他被控向朴槿惠密友崔顺实控制的组织行贿，以确保对三星两家子公司合并的支持，进而巩固他对三星集团的控制。韩国检察官就这起丑闻起诉了包括李在镕在内的17人，随后首尔中央地方法院判处李在镕五年有期徒刑，罪名是贿赂、在海外隐藏资产和挪用公款。
2018年，在上诉法院将李在镕的刑期减至两年半并缓刑四年执行后，他从监狱获释。其律师表示，他们将继续向最高法院上诉，试图推翻判决。2019年，韩国最高法院将李在镕的案件发回首尔高等法院进行重审。
2020年，检察官起诉李在镕和其他10人，指控他们与2015年三星两家子公司80亿美元的合并案中存在会计欺诈和操纵股价行为。2021年1月18日，首尔高等法院判处李在镕两年半有期徒刑，他被迫重返监狱。4月22日，李在镕被控会计欺诈和操纵股价的审判开始。8月9日，李在镕的假释请求获批。
会计欺诈和操纵股价
除了挪用公款，李在镕还卷入其他多起案件中。检察官辩称，2015年三星集团两家子公司三星C&T和Cheil Industries价值80亿美元的合并涉及非法活动，旨在巩固李在镕对该集团的控制。
李在镕于2020年9月被起诉，被控违反了《资本市场法案》（Capital Markets Act）进行不公平交易和操纵市场价格，在业务过程中违反信托责任。此外，他还被控违反《外部审计法案》（External Audit Act），涉及虚假披露信息和会计欺诈。
李在镕否认了这些指控，他的律师辩称，合并及其条款属于正常的商业决定范围。庭审始于去年10月，到目前为止主要集中在一名证人、三星证券员工的证词以及内部文件和电子邮件方面。由于案件的复杂性和新冠肺炎疫情导致的听证会延误，预计这种情况至少会持续到明年年底。
法律专家表示，如果李在镕被判有罪，他可能会再次被送进监狱。在这类案件中，任何判决，包括是否缓期执行，都将取决于法院对被告获得多少钱的评估。
被控非法使用镇静剂
6月下旬，首尔中央地方法院下令李在镕接受审判，以回应有关非法使用镇静剂的指控。然而，这与韩国检察官因李在镕涉嫌非法使用镇静剂而寻求5000万韩元（约合4.5万美元）罚款的计划不符。