据中国媒体《环球时报》3月7日引述微博网民爆料称，NED在2020年里至少投入了1,000万美元，为分裂中国的势力提供资金、人力乃至媒体宣传上的支持。
经过查询发现，2月24日，NED在其官网上公布了其在2020年各地区的活动经费，其中包括了中国香港、内地、新疆和西藏这4个中国的地区。
NED官网上列出对中国四个地区的具体投入。（美国国家民主基金会官网）
其中，NED还在其官网上用“东突厥斯坦”称呼新疆。
报道称，在点开这4个地区的条目后，便可以看到NED在中国这四个地区的具体“投资”。
NED官网上显示，该组织在2020年向新疆投入了124万美元；向西藏投入了约108万美元；向香港投入约204万美元。
值得关注的是，根据NED在其官网上列出的数据，计算了其在新疆、西藏、香港和内地四个地区的投入，发现NED在内地的投入占到了其2020年所公开的1,000多万美元的总投入的57%之多，约为585万美元。
报道指出，这些用于干涉中国内政的项目，打着“工人权利”、“妇女权利”和“人权”旗号的各类“维权”旗号的项目是其中最主要的组成部分，同时该组织还希望借“言论自由”进一步渗透和操控中国的网络空间与舆论场。
客观上来讲，该组织的做法在中国有利于促进“平权”，但具有民族情绪的《环球时报》认为，此举是在分裂和颠覆中国。
针对NED近年来的举动，中国在2019年和2020年先后两次制裁了这个组织以及该组织的负责人。中国外交部发言人赵立坚在2020年10月14日回应称，一段时间来，美国有关方面不断渲染炒作外国对美国的所谓“渗透”和“影响”，打压限制甚至恐吓美地方、高校、智库等开展对华交流。这种干扰破坏中美正常人文交流的行径与美方自我标榜的所谓“自由、开放”背道而驰，与两国民意背道而驰，暴露出美国一些政客的虚伪、虚弱和缺乏自信。美方应抛弃冷战思维和意识形态偏见，停止将人文交流政治化的错误做法，多做有利于中美互信与合作的事情。
但NED在2020年11月30日在其官网上表示，中国政府的封杀“不会影响”其对华活动。