一个国际科学家团队创造了一种强大的新资源,以加快开发疫苗和治疗方法,对抗下一次大流行。弗吉尼亚大学医学院研究员Wladek Minor博士与中国和波兰的合作者开发了一个互联网信息系统,称为virusMED,它列出了我们所知道的关于75个不同病毒家族的800多个病毒株的原子结构和潜在的脆弱性,包括SARS-CoV-2、流感、埃博拉和HIV-1。包括首席调查员郑和平在内的几位合作者是Minor在弗吉尼亚大学实验室的前学生和成员。
这种潜在威胁的蛋白质的新全景将帮助科学家们快速有效地应对下一个准备对人类造成破坏的病原体。Minor和他的合作者将这一资源与Google地图相提并论,因为它组织并注释了病毒的主要兴趣点,科学家可以将其作为药物和疫苗开发的路线图。
“与COVID-19的战斗还没有结束,但我们已经迫不及待地开始为下一次大流行病做准备。”弗吉尼亚大学分子生理学和生物物理学哈里森特聘教授Minor说:“VirusMED是向先进的信息系统迈出的一步,该系统将具有不同专长的研究人员聚集在一起,应对复杂的生物医学挑战。virusMED中包含的信息将帮助来自许多学科的病毒研究人员,特别是那些从事药物设计或抗病毒治疗的研究人员。我们提供新颖的结构分析,并整合来自各种资源的相关信息,以提供蛋白质最重要和最脆弱区域的全面情况。”
通过迅速解开SARS-CoV-2病毒的作用机制,科学家们能够为COVID-19开发安全有效的疫苗。Minor的新数据库旨在将这类关键信息放在一个方便的位置,让科学家们触手可及。
VirusMED包含关于病毒种类和毒株、宿主、病毒蛋白和抗体的广泛信息,以及已经被美国食品和药物管理局(FDA)批准的药物,以及其他重要的科学数据。研究人员将病毒上的兴趣点称为“热点”,而这些“热点”是药物和疫苗开发的有力起点。
Minor实验室的研究人员David Cooper博士说:“为治疗COVID-19而开发的最有前途的毒株不同的抗体疗法之一,就是利用这类信息来改进早在2003年从一名被SARS病毒感染的幸存者身上分离出来的独特抗体。那些对快速药物和疫苗设计感到惊讶的人没有意识到,今天的研究人员是在以前几十年的研究基础上进行的。”
Minor说,virusMED的主要优势之一是它将有关病毒的现有知识汇集到一个地方。以前,这些数据分散在多个资源中,而且往往是“孤岛”"式的,因此不容易获取。通过virusMED,研究人员可以按病毒或他们感兴趣的“热点”来浏览信息。
这个免费的、供所有人使用的数据库可以在https://virusmed.biocloud.top获得。
“我的实验室的目标之一是制作其他科学家可以使用的工具。我们着眼于森林,并找到帮助他人关注树木的方法,”Minor说。“资源生成并不迷人,但科学的最终目标是让生活变得更好。该论文的一位匿名同行评审员声称他们立即成为该系统的热心用户。我们期望virusMED真的能带来改变。”