据台湾中时新闻网等多家媒体报道，台“海巡署”声称，“第九海巡队”14日在金门北碇东1.1海里海域执行巡逻任务，发现一艘大陆快艇“越界”撒网捕鱼。在追逐过程中，大陆船只翻覆，导致船上4人落海，之后全部被救起，但其中2人丧生。台“海巡署”辩称，大陆船只越界捕鱼且拒检。
涉事大陆船只上4人落海，船上人员被送医抢救 图自台湾ETtoday新闻云报道配图
台湾《中国时报》称，4名船员中身亡的大陆籍人员为四川人和重庆人，其中一人是船长；生还的两人为四川与贵州人，目前台湾海基会经辗转联络，已联系上4名渔民的家属。他们预计这几天会经“小三通”模式来到金门。金门“立委”陈玉珍16日称，据她了解两名往生者都会游泳，为何会溺水？这些要调查清楚。
国台办发言人朱凤莲14日在记者会上对遇难同胞及其家属表示深切哀悼与诚挚慰问，并向台方表达强烈谴责。朱凤莲表示，一段时间以来，民进党当局以各种借口强力查扣大陆渔船，以粗暴和危险的方式对待大陆渔民，这是导致这起恶性事件发生的主要原因。
然而，台湾陆委会却宣称，台方海巡单位执法“过程并无不当”，还说为维护渔民权益需“严正执法”。台湾政治大学兼任教授高永光16日撰文称，陆委会的说法恍如把罹难者已经视为“罪犯”，没有展现任何人道立场关怀，“除了‘可恶’可以形容外，没有其他形容词了”。该文章称，这种回应对于处理越来越严峻的两岸形势没有任何帮助，“难道一定要搞到敌意螺旋无限上升，最后兵戎相见，民进党才会高兴？”台湾地区前领导人马英九17日表示，这类事件难免发生，应该依法秉公处理，并批台当局与大陆不对话，是“非常不可想象的事情”，“要怎么解决问题呢？”
图为国台办发言人朱凤莲，其就此事再次发声
国台办17日就此事再次发声。朱凤莲表示，这一恶性事件引起大陆各界强烈愤慨，严重伤害两岸同胞感情。朱凤莲称，海峡两岸同属一个中国，台湾是中国领土不可分割的一部分。两岸渔民自古以来在厦金海域传统渔场作业，根本不存在所谓“禁止、限制水域”一说。台方应尽快放船放人，做好善后工作，查明事实真相并严肃处置相关责任人，给遇难人员家属和两岸同胞一个交代。大陆方面保留采取进一步措施的权利，一切后果由台方承担。
金门县长陈福海15日深夜在脸书发文，对罹难的渔民表达由衷的遗憾与哀悼。陈福海说，对此突发不幸事件，他立即指示副县长李文良统筹大陆事务办公室，针对受伤大陆渔民及罹难者家属在后续相关出入境需求，全力给予人道关怀及行政协助。他表示，金门与厦门经济海域相连，彼此的重要渔场相互重叠。他盼望两岸开启金厦渔民生计议题理性和平的务实对谈，进而推展出互利共好的契机。
这是农历新年前后民进党当局第二次发生影响两岸关系的恶劣事件。就在春节前的2月7日，台“交通部”突然宣布取消本应在3月1日恢复的赴大陆旅游团，台“观光署”宣布即日起停止招揽赴大陆旅游团业务，激起岛内旅游业者众怒，痛批“年夜饭都吃不下”。台“行政院长”陈建仁17日早率队拜会民众党党团时，该党党团总召集人黄国昌批评“禁团令”没有法律基础，台“交通部”给出的理由甚至还提到“防疫需要”，“疫情指挥中心早就解散了”。陈建仁仅称，会尽快和陆委会、“交通部”了解状况。国民党“立委”翁晓玲17日批评称，台“观光署”根本没有法律依据禁赴陆旅游团，“交通部”和“观光署”沦为台当局防务单位的打手，令人不齿。
台湾《联合报》称，民进党当局日前突袭式宣布停招陆客团，再加上渔船事件，再度牵动两岸敏感神经。有知情人士直言，如今两岸缺乏互信，以往类似事情可通过管道沟通，“现在两岸失联，让已经结冰的两岸关系雪上加霜”。