综合台媒消息，6日晚到货的59.4万剂疫苗并非立刻就能给接种，需要先完成通关程序，还要运到指定的冷储物流中心进行后续检验封缄作业，再提供给新冠肺炎接种计划所列实施对象进行接种。这一套流程本身也得花费一定时间，最快也要15日才能开打。然而，当天下午，指挥中心就“提前”表示，这批疫苗到月底（11月30日）就过期。也就是说，该批疫苗的实际有效期只有15天。
对此，指挥中心负责人庄人祥的解释是，这是国际交货的问题，“国际间疫苗供货不稳定，交货时程较难确定”，其随即话锋一转称，本来对方要给台湾更多疫苗，但都是同一效期，指挥中心评估过了，认为59.4万剂AZ疫苗可在效期内接种完毕，所以才接受这批疫苗到货。
庄人祥还宣称，第14轮疫苗接种预计在11月13日至19日施打，先把有效期近的疫苗用掉；第15轮也会在11月底前开打，这批AZ使用上都来得及，“会提醒地方、医疗机构先使用这批AZ，应该没问题。”
这个说法显然无法服众，当日，国民党“立委”温玉霞就质疑，指挥中心说国际还在抢疫苗，既然大家在抢，为何还有临期货？又为何台湾会拿到“临期货”？温玉霞表示，本月4日，到期的一批AZ有效期是到明年2月28日，她那时就觉得不应该，没想到新到的一批有效期更短，其质疑指挥中心到底是如何采购的？
昨天（7日），国民党台北市议员王鸿薇也指出，目前台湾到货疫苗保存期限少于1个月的，除了第13批自购的AZ以外，还有9月初日本捐赠的一批AZ，有效天数26天，结果没想到，日本不打的疫苗有效期比蔡政府花费民众血汗钱买的（有效期）还多2天（按照疫苗到货时间计算）。
王鸿薇质疑，“到底是什么样的采购合约，会容许卖方让临期品出货？蔡政府为何一直不敢公布采购合约？还是从头到尾根本就没有合约，买的都是中间商的二手货呢？”
昨晚，岛内PTT论坛上，一网友发帖，如何避免打到临期的AZ，网友们纷纷跟帖揶揄，“打高端呗”“疫苗问题一律建议高端疫苗”“打高端人生顶端”。
今天，岛内知名媒体人赵少康也发声表示，就算打疫苗，也希望打一个有效期长一点的，“我更担忧这一批疫苗是不是卖到别的地方，人家退货再转过来，那转来转去品质有没有影响？今天打疫苗打到快到期的？心里总是毛毛的，这样的疫苗为什么要呢？”
赵少康认为，虽然，指挥中心保证“能打完”，但话不是这样讲，并且这批疫苗如果是别人送的也就罢了，可这是自己花钱买，为什么要买这样的疫苗呢？“这很荒谬”。
针对此前庄人祥所谓“国际间疫苗供货不稳定，交货时程较难确定”的说法，今天，台湾疫情指挥中心记者会上，岛内卫生部门前负责人杨志良也质疑“是不是因为合约没签好，或是指挥中心蓄意拖延？”
台北市长柯文哲则直言“我昨天听到那个庄人祥在讲，奇怪，他是智商不到70是不是？要找理由也要找好一点的，一听就是白痴的理由，一听到就知道很离谱，如果疫苗供应不足，一出厂就应该马上被买走，怎么会快到期了呢？有时候认错就好了，啰里吧嗦讲一大堆干什么？”
对此，指挥中心负责人陈时中则称，“这样污名化别人不好，人不是只有智商而已。”对于此番争议，庄人祥仅简单回应称，“我们只希望让需要接种第二剂的人尽快接种，谢谢。”