接报后，上海海上搜救中心立即协调东海救助局派“东海救101”轮前往现场救助，协调东海航海保障中心设AIS虚拟航标、尽快设置沉船应急示位标并实施扫测，协调东海预报中心推算人员漂流轨迹，播发航行警告。吴淞海事局派海事巡逻艇前往现场处置，协调打捞船、拖轮、清污船、过往船舶等7艘船舶参与搜救，吴淞VTS(水上交通管理中心)实施长江口深水航道单向通航，点对点进行船舶交通组织，同时持续做好安全信息播发，严防发生次生事故。
14日凌晨，东海救助局“东海救101”轮在海面救起7名遇险人员并打捞1具遇难者遗体，吴淞海事局“海巡012”救起1人；“沪港引6”救起2人。
目前现场：海巡艇“海巡0103”“海巡012”，专业救助船“东海救101”“东海救102”，5艘拖轮、4艘疏浚船、4艘清污船、2艘打捞船、1艘引航船，过往商船“中外运青岛”“中昌398”“长鲸9”“恒裕”等共20余艘船舶参与搜救。现场西北风6-7级，浪高3米。
据信息显示，“长锦海洋”轮为安提瓜和巴布达籍集装箱船，长165米，总吨17769，载集装箱1285TEU，船员19人，目前在长江口锚地抛锚；“新其盛69”轮是厦门其盛海运有限公司所属集装箱船，长165.35米，总吨12788，装载650个集装箱。
目前搜救行动仍在紧张进行，事故原因还在进一步调查中。